Tout le monde sait ce qu'est le cerveau, mais tout le monde ne sait pas ce qu'est le microbiome. C'est le complexe de virus, de bactéries et de champignons qui joue un rôle crucial dans notre santé et nos fonctions cognitives. Toute une population de collaborateurs vivant dans nos corps, pour faire court.
Aussi connue sous le nom de microbiote, cette «armée» est basée depuis longtemps dans le tractus gastro-intestinal, selon la science. On sait depuis peu qu'on le trouve aussi dans la peau. Selon la science, on a longtemps cru que différentes zones du corps en étaient dépourvues : par exemple l'œil et l'utérus. Les avancées récentes en matière de diagnostic ont récemment permis d'identifier un microbiome du placenta et un de l'œil, tous deux présents chez les personnes en bonne santé. À ce stade, il est raisonnable de s'attendre à d'autres découvertes sous peu.
Sommes-nous sûrs, par exemple, que le cerveau est une zone stérile et sans bactéries, ou possède-t-il un microbiome ? C'est l'objet de l'incroyable intervention lors de la conférence de la US Society of Neuroscience en novembre 2018. Une équipe de recherche de l'Université d'Alabama - Birmingham (UAB), dirigée par le Dr Rosalinda Roberts, a montré des images microscopiques à haute résolution du cerveau de souris et d'humains. Ces images montrent clairement des bactéries à l'intérieur des astrocytes, les cellules qui interagissent avec les neurones du cerveau.

Comme tant de groupes de découvertes étonnantes, celui-ci ne cherchait pas du tout de bactéries dans le cerveau. Le fait que le cerveau soit une zone stérile était bien établi dans le monde scientifique.
La chercheuse Courtney Walker comparait au microscope des images du cerveau de personnes en bonne santé avec celles de personnes atteintes de schizophrénie pour les différences structurelles lorsqu'elle est tombée sur la découverte. Après la première surprise, l'analyse a été étendue à tous les cerveaux humains que le laboratoire avait en analyse. Tous les 34 avaient des bactéries.
Les premières enquêtes
Pour déterminer si leur présence était le résultat d'une contamination après la mort, le Dr Roberts et son équipe ont étudié le cerveau de souris vivantes et immédiatement après la mort. Étonnamment, des bactéries y ont également été trouvées.
Peut-être que la contamination s'est produite lors de la préparation des échantillons de cerveau à analyser? Même les analyses dans des environnements stériles ont fourni des indices dans un sens.
L'analyse approfondie
À ce stade, l'équipe a utilisé le séquençage de l'ARN pour identifier le type de bactéries présentes dans le cerveau des souris et des humains. Tout le monde est Firmicuti, protéobactéries e bactéroïdes trouve couramment dans l'intestin. Comment se sont-ils retrouvés dans le cerveau ?
Ces premières observations étonnantes laissent ouvertes de nombreuses questions : Ces bactéries sont-elles de type « coopératif » ou pathologique ? La quantité et la composition du microbiome cérébral changent-elles avec le temps ? D'où viennent ces bactéries ? Des questions qui trouveront peut-être une réponse à propos de la récente découverte d'un système immunitaire dans le cerveau. Tous ces changements conduiront à l'explosion de ce qui est aujourd'hui un domaine scientifique encore émergent : la psychoneuroimmunologie.
Il est devenu aussi archaïque que les croyances des années 1300 croient que les bactéries ne sont qu'un ennemi à combattre. Depuis un certain temps, nous savons que nous hébergeons des villes entières, des nations, des planètes dans notre corps : des populations infinies d'organismes qui vivent avec nous, "travaillent" avec nous et nous aident dans de nombreux cas.