« Analyser les eaux usées vous donne une idée du nombre de cas au sein d'une communauté et si ces chiffres augmentent ou diminuent » dit le chercheur Ian Pepper.
Les chercheurs utilisent les égouts municipaux pour surveiller l'incidence quelques exemples de communautés dans le coronavirus américain.
L’équipe affirme qu’elle peut utiliser la surveillance des eaux usées pour déterminer si le virus existe (et quelle est son étendue) dans une communauté, même si les gens ne présentent aucun symptôme. Le système peut également surveiller et garantir l'efficacité du processus de traitement des eaux usées d'une municipalité.
« Analyser les eaux usées vous donne une idée du nombre de cas au sein d'une communauté et si ces chiffres augmentent ou diminuent.", il prétend Ian Pepper, directeur du Water and Energy Sustainable Technology Center (WEST) de l’Université de l’Arizona.
« Cette approche peut également être utilisée pour déterminer si une intervention permet de réduire la transmission du virus. »
« Nous serons en mesure de déterminer si le virus persiste dans la communauté même si aucun nouveau cas n’est signalé. » dit Charles Gerba, microbiologiste et professeur de sciences de l'environnement au Collège d'agriculture et des sciences de la vie. "Pour moi, c'est une clé pour suivre la propagation d'un virus."
Un précédent illustre: les études sur le poliovirus
Les microbiologistes environnementaux ont utilisé des programmes de surveillance des eaux usées pour étudier les virus pathogènes pendant des décennies, en particulier dans les efforts de santé publique visant à éradiquer le virus à l'échelle mondiale. responsable de la polio.
Grâce au développement d'un vaccin antipoliomyélitique et aux programmes mondiaux de vaccination, la transmission du poliovirus a considérablement diminué au cours des 26 dernières années. Seuls trois pays dans le monde ont encore une émission en cours: le Nigéria, l'Afghanistan et le Pakistan.
Étant donné que les personnes peuvent être infectées sans présenter de symptômes, les experts ont utilisé des programmes de surveillance environnementale pour détecter la transmission silencieuse du poliovirus par excrétion virale présente dans les eaux usées communautaires.
Grâce à ses capacités de laboratoire avancées et à son expérience dans la recherche sur les coronavirus, le Centre WEST peut également effectuer une surveillance des eaux usées pour le COVID-19. Située au sein de l’usine de traitement des eaux du comté de Pima en Arizona, l’installation possède une vaste expérience dans la détection de virus pathogènes humains dans les eaux usées.
« Nous avons testé l’hépatite A, les entérovirus et les norovirus. Nous avons environ 15 virus différents que nous testons régulièrement dans les eaux usées. »il dit Walter Bétancourt, microbiologiste expérimenté en virologie environnementale et professeur adjoint de recherche au Département des sciences de l'environnement.
Coronavirus dans les égouts
Le premier coronavirus (qui tire son nom de la « couronne » de pointes à sa surface) a été identifié pour la première fois au milieu des années 60. Dans le monde, 7 coronavirus différents sont connus pour infecter les humains et provoquer des maladies. 4 des coronavirus sont assez courants. Trois autres, dont le MERS-CoV, le SARS-CoV et le SARS-CoV-2, sont apparus ces dernières années et sont des exemples de virus zoonotiques qui n'infectaient autrefois que les animaux et sont maintenant passés de l'espèce à l'homme.
Le COVID-19 est une nouvelle maladie. Il reste encore beaucoup à apprendre sur sa transmission, la gravité des troubles qu’elle provoque et sa capacité à se propager.
Le Centre WEST a mené une étude en 2008 qui mesurait la survie des coronavirus dans les égouts. Il a constaté qu'ils meurent rapidement, avec une réduction de 99,9% en deux ou trois jours.
Avec leur programme de surveillance des eaux usées, les chercheurs utiliseront des méthodes moléculaires et des cibles d'acide nucléique. Grâce à ces méthodes, ils pourront détecter des marqueurs génétiques du SRAS-CoV-2 dans des échantillons prélevés avant et après le traitement des eaux usées.
Il est important de corréler les concentrations virales dans les eaux usées avec le nombre d'infections enregistré. Il peut aider les autorités de santé publique à mieux se préparer pour l'avenir.
Une enquête plus approfondie sur le coronavirus est toujours la bienvenue. À partir de la surveillance des égouts et des approches de séquençage de nouvelle génération. Ils peuvent aider à identifier les variantes circulant dans la population et à évaluer l’efficacité des stratégies d’atténuation pour contrôler et prévenir la maladie.
source: Université de l'Arizona