Notre corps est une véritable métropole, et celui du microbiome intestinal est de loin la communauté la plus nombreuse et la plus influente. Cet écosystème complexe de micro-organismes joue un rôle crucial dans de nombreux aspects de notre santé : de la digestion à l'ambiance, en passant par le système immunitaire.
Mais comment ces bactéries savent-elles où se « garer » dans le labyrinthe complexe de notre intestin ? Et surtout, comment faire en sorte que les « bons » prévalent ?
Grâce à une étude révolutionnaire, nous avons désormais une réponse.
À l’aide d’une technique d’imagerie sophistiquée, les chercheurs ont identifié les gènes qui permettent à des souches bactériennes spécifiques d’adhérer de manière stable à des niches intestinales spécifiques. Un peu comme trouver la place de parking idéale dans une ville chaotique. Les implications sont énormes : cette découverte ouvre la voie à une nouvelle génération de probiotiques ultra précis et personnalisés. Êtes-vous prêt à laisser le microbiome intestinal entrer dans le futur ?
Ici vous trouvez l'étude de Carnegie Science publié dans le magazine Science.
Le microbiome intestinal, un micromonde crucial pour la santé
Ces dernières années, comme mentionné, plusieurs études ont établi un lien entre les altérations du microbiome et un large éventail de pathologies, du cancer du sein au la sclérose en plaques, de la glycémie à la personnalité. Bref, s’il y a une chose que nous avons appris, c’est que nous ne pouvons plus ignorer ces colocataires microscopiques.
Cependant, pour fonctionner au mieux, le microbiome intestinal a besoin d’un équilibre délicat entre les bactéries bénéfiques et non bénéfiques. Et ce n'est pas tout : chaque espèce bactérienne doit trouver sa niche écologique, son « foyer » dans le labyrinthe complexe de l'intestin. Il l'explique bien William Ludington de la Carnegie Institution for Science,
Nous parlons d’un système incroyablement complexe de communautés microbiennes interconnectées, et chaque espèce doit se rendre au bon endroit où elle peut prospérer et contribuer à la santé de son hôte.
Une découverte fondamentale
L'équipe de Ludington a développé une technique d'imagerie innovante qui leur a permis d'observer en temps réel et à haute résolution comment une seule cellule Lactiplantibacillus plantarum, une bactérie bénéfique, colonise l'intestin d'une mouche des fruits.
Le choix de la drosophile n’est pas aléatoire : son microbiome est beaucoup plus petit et plus défini que celui de l’humain, ce qui en fait un modèle idéal pour ce type d’étude. "Développer cette technique d'imagerie était un défi passionnant", dit-il Ren Dodge, co-auteur de l'étude.
Cela nous a permis de voir les interactions de cellules bactériennes individuelles avec l’intestin de l’hôte avec des détails sans précédent.
Microbiome intestinal, qu’ont-ils découvert ?
En résumé : une colonisation réussie dépend de protéines appelées adhésines, présent à la surface de la bactérie. Comme leur nom l’indique, les adhésines permettent aux bactéries de se « coller » à d’autres cellules, tissus ou structures du corps.
Mais il y a un problème : Les adhésines ne sont généralement pas très sélectives quant à l'endroit où elles adhèrent et l'attachement est transitoire. Au lieu de cela, en utilisant leur technique d'imagerie innovante, les chercheurs ont observé que les adhésines utilisées par Lactiplantibacillus plantarum isolé des mouches des fruits sauvages attachées de manière stable au tissu intestinal de l'hôte.
En revanche, la Lactiplantibacillus plantarum d'origine humaine n'a formé qu'un attachement de courte durée. En y regardant de plus près, les chercheurs ont identifié la base génétique de l'adhérence améliorée de la bactérie dans une niche intestinale spécifique.
Vers des super-probiotiques personnalisés
"En identifiant les gènes qui permettent à L. plantarum de coloniser des niches spécifiques, nous disposons désormais des connaissances nécessaires pour apporter une plus grande précision à d'autres bactéries", explique Kevin Aumiller, co-auteur principal de l'étude.
Cela ouvre la porte à la création de probiotiques optimisés pour des niches spécifiques de l’intestin humain.
Imaginez : au lieu des probiotiques génériques « à taille unique » actuellement disponibles, nous pourrions en avoir un à l'avenir des cocktails bactériens sur mesure, avec des souches conçues pour adhérer parfaitement à des régions spécifiques de notre intestin. Un peu comme avoir un entraîneur personnel pour notre microbiome.
L’avenir est bactérien
Bien sûr, il est encore tôt : il faudra encore beaucoup de recherche pour traduire ces découvertes en probiotiques de nouvelle génération, sûrs et efficaces pour les humains. L’avenir de la santé est cependant « marqué » par le microbiome intestinal.
Grâce à des études pionnières comme celle-ci, nous commençons à déchiffrer le langage complexe de nos habitants microscopiques. Et bientôt, nous pourrons peut-être guider précisément les bonnes bactéries là où nous le souhaitons, à la manière d’urbanistes expérimentés de notre univers intérieur.
Alors préparez-vous : la prochaine frontière de la médecine pourrait être en nous. Et cela pourrait avoir le goût d’un probiotique ultra précis et personnalisé. Le futur n’a jamais été aussi… bactérien.