22 janvier dernier Dave O'Connor e Tom Friedrich ont invité plusieurs dizaines de collègues aux États-Unis à rejoindre un nouvel espace de travail sur la plateforme de messagerie instantanée Slack.
Des scientifiques, tous deux du Centre national de recherche sur les primates du Wisconsin, avaient eu connaissance d'une nouvelle maladie à coronavirus qui émergeait en Chine. Ils pensaient que la recherche scientifique devrait coopérer pour répondre à certaines questions importantes sur sa biologie.
« Nous avons envoyé une alerte à un groupe d'enquêteurs et leur avons dit en gros : 'Hé, parlons-en.'Dit O'Connor. L'idée était de coordonner la recherche et de s'assurer que les résultats étaient comparables, ajoute-t-il. Frédéric.
Naissance du clan Wu-han
Parodiant le groupe hip-hop Wu-Tang Clan, les chercheurs ont surnommé l'espace de travail commun qu'ils ont créé sur Slack « Wu-han Clan ».
Le clan Wu-han n’est qu’un exemple de la manière dont l’épidémie de COVID-19 transforme la façon dont les scientifiques communiquent sur les crises sanitaires en évolution rapide.
Une énorme quantité de données il est publié quotidiennement par les serveurs prépresse, qui n'existait même pas il y a dix ans. Ils sont ensuite analysés à partir de plateformes telles que Slack et Twitter et dans les médias, avant même le début de l'examen formel par les pairs.
Le personnel des revues scientifiques fait des heures supplémentaires pour faire réviser, réviser et publier les manuscrits à une vitesse record.
Le vénérable New England Journal of Medicine (NEJM) a publié un document COVID-19 dans les 48 heures suivant l'envoi. Les génomes viraux publiés sur une plateforme appelée GISID, plus de 200 à ce jour, ils sont instantanément analysés par une phalange de biologistes évolutionnistes qui partagent leurs arbres phylogénétiques en prépresse et sur les réseaux sociaux.
« C’est une expérience très différente de toutes les autres auxquelles j’ai participé. » dit l'épidémiologiste Marc Lipsitch de la Harvard TH Chan School of Public Health. Cette communication intense a catalysé un niveau inhabituel de collaboration entre scientifiques qui, combiné aux progrès scientifiques, cela a permis à la recherche d'avancer plus rapidement que n'importe quelle épidémie précédente.
"En seulement 6 semaines, une quantité de connaissances sans précédent dans l'histoire de l'humanité a été générée et partagée", dit-il. Jérémy Farrar, chef du Wellcome Trust.
Recherche scientifique 2.0
La lenteur de la communication scientifique a souvent été un problème lors des épidémies passées. Les chercheurs se sont parfois échoués sur des données cruciales jusqu'à ce que leur article soit accepté par un journal de haut niveau et évalué par des pairs parce qu'ils craignaient que des concurrents puissent voler des informations.
Même lorsque les chercheurs étaient disposés à partager leurs découvertes à l’avance, il n’existait pas de plateforme naturelle pour le faire.
Lipsitch a compris il y a quelques années que les serveurs prépresse, qui publient les résultats avant la revue par les pairs, auraient pu changer les règles du jeu.
Les scientifiques pouvaient publier rapidement de nouvelles données et toujours obtenir du crédit, quel que soit l'endroit où le travail a été publié ultérieurement.
In un document de 2018, Lipstich et d'autres collègues ont conclu que ce système avait accéléré la diffusion des données lors de l'épidémie de Zika de 2015-2016 et de l'épidémie d'Ebola en Afrique de l'Ouest de 2014-2016.
La plupart des pré-impressions sont apparues plus de 100 jours avant qu'un journal publie l'ouvrage. Et dans l'ensemble, moins de 5% des articles de revues sur les deux flambées ont d'abord été publiés en prépresse.
Coronavirus, un saut évolutif
L’épidémie de COVID-19 a peut-être changé à jamais l’histoire de la recherche scientifique. Au début de cette semaine, plus de 283 articles étaient déjà parus sur les serveurs de prépublication, contre 261 publiés dans des revues scientifiques.
Deux des plus grands serveurs prépresse biomédicaux, bioRxiv et medRxiv, « reçoivent actuellement une dizaine d’articles chaque jour sur certains aspects du nouveau coronavirus »il dit John Inglis, responsable de Cold Spring Harbor Laboratory Press, qui gère les deux serveurs. Une masse de données qui « C'est un défi pour nos petites équipes, qui travaillent aussi le soir et le week-end ».
Une grande partie de ce travail, effectué par le personnel et des scientifiques externes, consiste à examiner les observations pour éliminer les pseudosciences et les opinions.
Les manuscrits qui passent le premier filtre varient considérablement en qualité, explique l'épidémiologiste de l'Université de Hong Kong Keiji Fukuda. "Certains d'entre eux ne sont pas très utiles, d'autres sont extrêmement utiles" .
Anthony Fauci, directeur de l'Institut national américain des allergies et des maladies infectieuses, dit qu'il est tellement occupé qu'il lit souvent des prépublications tard dans la nuit.
"Onze heures arrivent, minuit arrive et vous avez 25 de ces choses à lire"dit Fauci. "Vous ne pouvez pas les ignorer."
Révolution de l'information
Les scientifiques partagent plus d'informations en utilisant les prépresse que n'importe quelle épidémie précédente. Le nombre d'articles publiés explose également.
C'est encore plus difficile pour les simples communicateurs, nous journalistes et le grand public.
Une prépresse du 31 janvier sur bioRxiv par des scientifiques indiens ont souligné des similitudes « troublantes » entre le virus responsable du COVID-19 et le VIH, alimentant les théories du complot sur le génie génétique.
Le document a reçu 90 commentaires critiques en 48 heures et a été rapidement retiré. (Un document formel de démystification des résultats il a été publié 2 semaines plus tard.)
Le danger de l’infodémie est à juste titre l’un des dangers collatéraux de situations d’urgence comme celle-ci. La recherche scientifique doit discuter de la manière de la gérer.
Cependant, les experts disent que les avantages d'un partage rapide d'informations l'emportent largement sur les inconvénients. De plus, même la publication par un journal principal ne garantit pas que la plainte est correcte.
Pour accélérer la recherche scientifique sur le coronavirus, il est vital de partager également des choses qui ne fonctionnent pas, dit-il OConnor, par exemple lorsque des expériences montrent qu'une espèce animale ne peut pas être infectée par le nouveau virus.
"Il s'agit d'informations importantes qui ne sont généralement pas partagées via les canaux traditionnels", il prétend. C'est pourquoi des groupes comme le clan Wu-han sont si utiles. Ses membres ont également discuté de l'opportunité de tester les animaux de manière traditionnelle, en mettant une suspension de virus liquide dans leur nez, ou par un aérosol, un mode d'exposition qui ressemble plus à un éternuement. (Ils essaieront probablement tous les deux.)
Y arriverons-nous dans peu de temps?
« En partageant ouvertement nos plans, nous pouvons réduire les licenciements », déclare Friedrich.
Il n'est pas clair si ces collaborations scientifiques permettront d'atténuer dans un court laps de temps le monde a frappé du coronavirus COVID-19.
Mais de nombreux scientifiques se félicitent de la façon dont l’épidémie a déjà modifié leur façon de communiquer.
« Il semble que les choses évoluent vers une toute nouvelle culture de la recherche scientifique. » dit le virologue Isabelle Eckerle du Centre des maladies virales émergentes à Genève.
