Une nouvelle variante du SRAS-CoV-2 avec un nombre inhabituellement élevé de mutations a été détectée en Afrique du Sud et semble avoir déclenché deux choses : une augmentation récente des cas et une augmentation très récente de la panique générale. Messieurs, voici Omicron. Voici une première sélection des données collectées autour.
Quand B.1.1.529 a-t-il été identifié pour la première fois ?
Première question. Il y a un article sur le site Web du Forum économique mondial daté du 12 juillet 2021. Trouvez-le ici. Cet article mentionne la variante B.1.1.529, découverte par des scientifiques en Afrique du Sud. En cliquant sur le lien relatif à la découverte, vous êtes directement catapulté vers un autre article, daté du 26 novembre 2021. La mention a été ajoutée plus tard, car dans le post original de juillet (vous pouvez le trouver ici) il n'y avait pas.
Par conséquent, les nouvelles selon lesquelles cette variante est déjà apparue l'été dernier sont fausses.
La variante Omicron a été détectée pour la première fois sur 23 novembre en Afrique du Sud à partir d'échantillons prélevés entre le 14 et le 16 novembre. Joe PhaahlaLe ministre sud-africain de la Santé a déclaré hier qu'il pensait que la variante était à l'origine d'une augmentation exponentielle des cas quotidiens de covid-19 à travers le pays. Hier, l'OMS l'a désigné comme une variante "digne d'attention" (préoccupation). Cela a conduit à la décision de plusieurs pays d'adopter des restrictions de voyage pour les personnes qui se rendent dans certains pays (Afrique du Sud, Botswana, Lesotho, Eswatini, Zimbabwe et Namibie) ou qui viennent de ces pays.
Que se passe-t-il en Afrique du Sud ?
Des cas quotidiens nationaux sont passés 274 11 novembre à 1000 deux semaines plus tard. Bien que le taux de croissance ait été rapide, les chiffres absolus sont encore relativement faibles. Plus de 80% des cas en Afrique du Sud se trouvent actuellement dans la province de Gauteng. Les 77 cas séquencés dans la province entre le 12 et le 20 novembre ont été identifiés comme étant la variante Omicron. Le nombre de reproduction estimé, le nombre moyen de personnes qu'une personne est susceptible d'infecter, est de près de 2 dans le Gauteng contre près de 1,5 dans tout le pays.
Que nous disent les mutations d'Omicron ?
La variante a une "constellation très inhabituelle de mutations", dit-il Sharon Paon de l'Université de Cambridge. Il existe plus de 30 mutations dans la protéine de pointe, la partie de la SRAS-CoV-2 qui interagit avec les cellules humaines. D'autres mutations pourraient aider la variante Omicron à contourner notre système immunitaire, mais (il faut le souligner) "cela n'a pas été prouvé".
La signification des mutations est actuellement théorique et ne repose pas sur des tests de laboratoire, mais sur l'expérience passée. Nous ne savons pas si Omicron réduira réellement l'efficacité des vaccins. Cependant, d'après les déclarations des scientifiques, le type de mutations elle compromettra certainement (il faut évaluer dans quelle mesure) l'efficacité des anticorps produits par les vaccins.
Les mutations d'une partie du virus sont similaires à celles observées dans les variantes Alpha et Delta, ce qui pourrait aider la variante à se propager plus facilement. Wendy Barclay de l'Imperial College de Londres pense qu'il est "très biologiquement plausible" que B.1.1.529 ait une transmissibilité plus élevée que Delta.
Les mutations d'Omicron le rendent susceptible d'être plus résistant même aux traitements par anticorps (comme ceux développés par Regeneron), dont il a été démontré qu'elles sauvent des vies. C'est effectivement une source d'inquiétude. À l'heure actuelle, cependant, il y aurait une petite note "positive": il n'y a absolument aucun signe qu'Omicron provoque une maladie plus grave.
Quelle est la diffusion actuelle d'Omicron ?
Le séquençage génomique a initialement trouvé la variante Omicron dans Afrique du Sud, Botswana e Hong Kong. Il y a aussi des cas signalés dans Israël, apparemment originaire d'un voyageur de Malawi, Et dans Belgique, par quelqu'un un voyageur d'Egypte.
Il est fort probable qu'Omicron se soit propagé à d'autres pays.
La variante Omicron surpassera-t-elle la Delta ? Sans en faire le tour : personne ne sait. Si cette variante s'avère moins transmissible que la Delta ce sera certainement une bonne nouvelle.
Qu'avons nous à faire?
Je ferme (pour l'instant) les nouvelles fraîches avec un espoir. André Pollard, le directeur de l'Oxford Vaccine Group qui a développé le vaccin AstraZeneca se dit optimiste quant à la tenue des vaccins même chez Omicron.
Pollard estime qu'une forte reprise après la pandémie est "peu probable". "La plupart des mutations" dans la variante Omicron "se trouvent aux mêmes endroits dans la protéine de pointe que les autres variantes" contre lesquelles les vaccins se sont avérés efficaces.
On verra. En attendant, que faire ?
Les mesures habituelles de distanciation sociale sont toujours une étoile du Nord. Le lavage des mains, le port du masque, la vaccination et le rappel sont des outils qui ont encore une certaine efficacité. Omicron nous met en garde contre le risque de taux de vaccination erratiques dans le monde : seulement 24% des personnes sont complètement vaccinées en Afrique du Sud. Nous devons aider les pays à revenu faible et intermédiaire à accéder aux vaccins.
